結合臨床資料及二代定序基因分析-提升學生實際操作及大數據分析能力
Combining clinical data with next generation sequencing (NGS) gene analysis - improving students’ practical operations and big data analysis capabilities
學期
107-1
學分
0
學分
當期課號
A012
永久課號
B0963
開課單位
教務處
授課教師
劉孜孜、張世慶、林明薇、楊佳鳳
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週一 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 結合臨床資料及二代定序基因分析-提升學生實際操作及大數據分析能力 YS419（陽明） 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
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先修科目
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備註
無備註
教學方式
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評分方式
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課程大綱
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週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | 課程規則介紹、遺傳學簡介(1) 2018/09/10 |
| 第 2 週 | 遺傳學簡介(2) 2018/09/17 |
| 第 3 週 | 2018/09/24 |
| 第 4 週 | 遺傳性大腸直腸癌 2018/10/01 |
| 第 5 週 | 基因體資料及其相關應用 2018/10/08 |
| 第 6 週 | 時間改到 10/19 第 7、8 節,遺傳性代謝疾病 2018/10/15 |
| 第 7 週 | 次世代定序的原理(Illumina) Application of Precision Medicine in Cancer Management 2018/10/22 |
| 第 8 週 | Probe 設計及各種 Library 設計 軟體介紹 CLC Genomics Workbench 2018/10/29 |
| 第 9 週 | 軟體介紹 CLC Genomics Workbench 各種軟體介紹及指令介紹 2018/11/05 |
| 第 10 週 | 期中考(open book) 2018/11/12 |
| 第 11 週 | 上機,分組參觀 (每組 4-5 人)at 基因體中心 Probe 設計及各種 Library 設計 2018/11/19 |
| 第 12 週 | 各種軟體介紹及指令介紹 上機,分組參觀 (每組 4-5 人)at 基因體中心 2018/11/26 |
| 第 13 週 | Whole Genome NGS Analysis and Demonstration, Target Genes NGS Demonstration 2018/12/03 |
| 第 14 週 | 資料分析實作–軟體安裝與定序檔案前處理 2018/12/10 |
| 第 15 週 | 資料分析實作–雲端定序分析與變異檢測 2018/12/17 |
| 第 16 週 | 資料分析實作–變異註解與視覺化檢視 2018/12/24 |
| 第 17 週 | 2018/12/31 |
| 第 18 週 | 臨床資料和 NGS 連結及討論 期末考(open book) 2019/01/07 |
教科書
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