遺傳資料分析
Genetic Data Analysis
| 節 | 週二 |
|---|---|
7 15:30–16:20 | 遺傳資料分析 YS107（陽明） 2 節連堂 |
8 16:30–17:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
介紹遺傳基因研究資料分析方法及軟體,包括:連鎖分析方法,基因關聯分析方法,haplotype 分析方法,全基因體分析方法等。
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無備註
隨著人類基因體計畫及後續相關計畫的完成,提供我們許多豐富寶貴的基因體研究資料,也帶動許多探索人類疾病相關基因研究計畫的蓬勃展開,本課程將介紹遺傳基因研究的資料分析方法,配合軟體之實際操作及實例分析,讓同學瞭解該如何運用這些分析方法及軟體以尋找人類疾病基因。
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction to genetic data analysis (I) 2021/02/23 |
| 第 2 週 | Introduction to genetic data analysis (II) 2021/03/02 |
| 第 3 週 | File system for genetic linkage analysis, Linkage analysis --- LINKAGE, GENEHUNTER 2021/03/09 |
| 第 4 週 | Linkage analysis --- GENEHUNTER 2021/03/16 |
| 第 5 週 | Case presentation I 2021/03/23 |
| 第 6 週 | Association data analysis 2021/03/30 |
| 第 7 週 | Cross-university activity (No class) 2021/04/06 |
| 第 8 週 | Genome-wide association study and genetic risk score 2021/04/13 |
| 第 9 週 | Haplotype analysis --- Haploview (I) 2021/04/20 |
| 第 10 週 | Haplotype analysis --- Haploview (II) 2021/04/27 |
| 第 11 週 | Haplotype analysis --- Haploview (III) 2021/05/04 |
| 第 12 週 | Case presentation II 2021/05/11 |
| 第 13 週 | Genome-wide association analysis --- PLINK (I) 2021/05/18 |
| 第 14 週 | Genome-wide association analysis --- PLINK (II) 2021/05/25 |
| 第 15 週 | Genome-wide association analysis --- PLINK (III) 2021/06/01 |
| 第 16 週 | Case presentation III 2021/06/08 |
| 第 17 週 | Final report 2021/06/15 |
| 第 18 週 | Final examination 2021/06/22 |
(1) Handbook of Human Genetic Linkage, 1994, Joseph D. Terwilliger &Jurg Ott, Johns Hopkins University Press (2) Genetic Analysis of Complex Disease, 2006, Jonathan L. Haines & Margaret A. Pericak-Vance, Wiley-Liss (藝軒書局) (3) A Statistical Approach to Genetic Epidemiology,2010, Andreas Ziegler and Inke R. Konig, Wiley-Blackwell
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