合成生物學實作
Synthetic Biology In Practice
| 節 | 週四 |
|---|---|
B 19:30–20:20 | 合成生物學實作 YR105（陽明） 2 節連堂 |
C 20:30–21:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
將合成生物學分為下列三個部份引領學生實際明瞭該領域之緣起、基礎,與最新之發展技術: 1. 合成生物學之組合零件與方法 2. 合成生物學系統之建立與模擬 3. 合成生物學系統之工程實作
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無備註
合成生物學以正向工程的方法探究與測試生物運作機制,並結合工程,電腦設計模擬與生物實作,以各式創意開發新的應用。本課程由淺入深,基於理論設計與實際操作之結合.
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Synthetic Biology in Practice: Introduction & Overview 2021/02/25 |
| 第 2 週 | Standardization, Abstraction, and Modularity 2021/03/04 |
| 第 3 週 | Parts Registry and Biobricks 2021/03/11 |
| 第 4 週 | Biobrick Assembly 2021/03/18 |
| 第 5 週 | In silico Biobrick Assembly 2021/03/25 |
| 第 6 週 | Engineering Techniques and Rules 2021/04/01 |
| 第 7 週 | Parts Design and Amplification 2021/04/08 |
| 第 8 週 | Midterm Discussion 2021/04/15 |
| 第 9 週 | In silico Gene Design 2021/04/22 |
| 第 10 週 | In silico Pathway Design 2021/04/29 |
| 第 11 週 | Genetic Circuit Construction 2021/05/06 |
| 第 12 週 | Genetic Circuit Modeling 2021/05/13 |
| 第 13 週 | Genetic Circuit Simulation 2021/05/20 |
| 第 14 週 | Integrated Genetic Circuit Design 2021/05/27 |
| 第 15 週 | Control of Circuit Constructs 2021/06/03 |
| 第 16 週 | Circuit Construct validation 2021/06/10 |
| 第 17 週 | New methods for synthetic biology 2021/06/17 |
| 第 18 週 | Final Report and Discussion 2021/06/24 |
Reference books (not required): Cell-Free Synthetic Biology Platform for Engineering Synthetic Biological Circuits and Systems (2019) Synthetic Metabolic Pathways - Methods and Protocols (2018) BioBuilder - Synthetic Biology in the Lab (2015) Whole-cell modeling for synthetic biology (2013) Synthetic Biology, Part B - Computer Aided Design and DNA Assembly (2011) Synthetic Biology - Methods for Part Device Characterization and Chassis Engineering (2011)
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