基因體數據分析
Genomic Data Analysis
學期
111-1
學分
0
學分
當期課號
131017
永久課號
MDBI30013
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
鍾翊方
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週二 |
|---|---|
3 10:10–11:00 | 基因體數據分析 YR102（陽明） 2 節連堂 |
4 11:10–12:00 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
介紹不同生物資訊分析方式於探究微陣列基因體數據
先修科目
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備註
無備註
教學方式
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評分方式
期末報告
課程大綱
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週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction to Microarray Data Analysis 9/13 |
| 第 2 週 | Microarray Data Preprocessing 9/20 |
| 第 3 週 | Detecting Differentially Expressed Genes (I) 9/27 |
| 第 4 週 | Detecting Differentially Expressed Genes (II) 10/4 |
| 第 5 週 | Hypothesis Testing 10/11 |
| 第 6 週 | Visualization 10/18 |
| 第 7 週 | Clustering (I) 10/25 |
| 第 8 週 | Clustering (II) 11/1 |
| 第 9 週 | Classification (I) 11/8 |
| 第 10 週 | Classification (II) 11/15 |
| 第 11 週 | Classification (III) 11/22 |
| 第 12 週 | Introduction to Weka & Orange 11/29 |
| 第 13 週 | Enrichment Analysis 12/6 |
| 第 14 週 | microRNAs and microRNA Target Genes 12/13 |
| 第 15 週 | Final project presentation 12/20 |
| 第 16 週 | Final project presentation 12/27 |
| 第 17 週 | NGS data analysis (I) 1/3 |
| 第 18 週 | NGS data analysis (II) 1/10 |
教科書
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Office Hours
- 地點
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- 時間
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- 聯絡方式
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