2 項進行中

115-1 選課時程

進行中

  • 初選第一階段 6/15 – 6/18
  • 初選第二階段 6/22 – 6/25
  • 校際選修 進行中 8/24 – 9/18
  • 初選第三階段 8/31 – 9/3
  • 開學後加退選 進行中 9/7 – 9/21
  • 逾期加退選 9/21 – 9/24
選課資源

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生物資訊學(一)

Introduction to Bioinformatics (I)

學期
112-1
學分
0 學分
當期課號
112530
永久課號
LSLS20016
開課單位
生命科學系暨基因體科學研究所
授課教師
鍾翊方、黃彥華
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
週四
7
15:30–16:20
生物資訊學(一)
YR103(陽明)
2 節連堂
8
16:30–17:20

* 根據陽明交大上課時間表所列

概述

This course will introduce different strategies and computational tools to analyze bio-molecular information, and next-generation DNA/RNA sequencing data, that may facilitate biomedical researches.

先修科目

Students enrolling in this course should have completed undergraduate courses in (1) Biochemistry and (2) Molecular Biology or Cell Biology. (*** Computer programming skill is not required.) This is not a course of computer language programming (本課程不是電腦語言程式課).

備註

無備註

教學方式

教師未提供此項資料

評分方式

課堂出席 turnout (20%), 作業 homework (20%), 期中考 mid-term exam. (30%), 期末考 final exam. (30%)

課程大綱

教師未提供此項資料

週次計畫
週次主題
第 1 週

Overview of bioinformatics

2023-09-14(四) 時數:[2023-09-14]黃彥華(2.00)
第 2 週

Bioinformatics data resources

2023-09-21(四) 時數:[2023-09-21]黃彥華(2.00)
第 3 週

Database search and sequence alignment

2023-09-28(四) 時數:[2023-09-28]黃彥華(2.00)
第 4 週

Detecting differentially expressed genes

2023-10-05(四) 時數:[2023-10-05]鍾翊方(2.00)
第 5 週

Classification and clustering

2023-10-12(四) 時數:[2023-10-12]鍾翊方(2.00)
第 6 週

Dynamic programming and motifs

2023-10-19(四) 時數:[2023-10-19]黃彥華(2.00)
第 7 週

De novo genome sequencing analysis

2023-10-26(四) 時數:[2023-10-26]黃彥華(2.00)
第 8 週

Mid-term exam.

2023-11-02(四) 時數:[2023-11-02]鍾翊方(2.00) 黃彥華(2.00)
第 9 週

NGS data analysis and disease gene finding (1)

2023-11-09(四) 時數:[2023-11-09]黃彥華(2.00)
第 10 週

NGS data analysis and disease gene finding (2)

2023-11-16(四) 時數:[2023-11-16]黃彥華(2.00)
第 11 週

Gene expression profiling (RNA-Seq, scRNA-seq, spatial transcriptomics)

2023-11-23(四) 時數:[2023-11-23]黃彥華(2.00)
第 12 週

Regulatory motifs

2023-11-30(四) 時數:[2023-11-30]黃彥華(2.00)
第 13 週

Systems biology

2023-12-07(四) 時數:[2023-12-07]黃彥華(2.00)
第 14 週

Artificial intelligence for biomedical researches (I)

2023-12-14(四) 時數:[2023-12-14]鍾翊方(2.00)
第 15 週

Artificial intelligence for biomedical researches (II)

2023-12-21(四) 時數:[2023-12-21]黃彥華(2.00)
第 16 週

Final exam

2023-12-28(四) 時數:[2023-12-28]鍾翊方(2.00) 黃彥華(2.00)
教科書

The materials edited and prepared by the instructor. Journal papers may be assigned by the instructors.

Office Hours
地點
黃彥華 (守仁樓三樓 309室)
時間
Students are encouraged to contact the instructors to schedule an appointment if they have any questions related to the lecture or homework assignments.
聯絡方式
黃彥華 yhhuang@nycu.edu.tw