結構生物資訊
Structural Bioinformatics
| 節 | 週四 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 結構生物資訊 BI305（博愛） 3 節連堂 |
6 14:20–15:10 | |
7 15:30–16:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
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無
無備註
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一、出席規定: 1. 112A恢復實體授課,地點在博愛校區賢齊館1F聯強國際會議廳。 2. 演講時間表:開學公告於E3教學平台、系所網頁(開學前及每次演講前一週皆會公告於系所[最新消息])。 3. 點名:現場掃QR-code簽到,簽到連結只開放10分鐘(1:20-1:30),投影在講台小布幕,每次上課都是新的連結,不重複使用。請務必準時簽到,遲到視為缺席。 4. 缺課或請假3次(含)以上(也就是最多只能缺席2次),學期成績以不及格論。 二、報告繳交規則: 1. 每次演講,請於當日晚上8點前將心得報告上傳至E3,超過時間系統將關閉不得繳交,亦不受理補交作業。缺交作業視為缺課。 2. 報告禁止抄襲或不當引用,使用Turnitin論文原創性比對系統 (E3-校內資源) 比對原創程度,並下載Turnitin生成的結果pdf檔作為最後繳交的心得報告。相似度請勿超過10%,否則以「缺課」論。 報告內容:中英文皆可,內容1至2頁A4紙,請寫上姓名-學號-日期。 報告檔名:日期_學號_姓名_ Turnitin相似度百分比 (0928_410355XXX_交陽明_5%) 3. 每學期一次的心理諮商師演講/宣導,該次演講不需繳交報告。 4. 專題演講課程以「通過」或「不通過」為成績。 三、課程公約 請勿未經同意側錄及散播演講內容。 三、課程助教聯絡方式 郭至恬 s70657417.ee11@nycu.edu.tw 李擎 leeching1207.bt11@nycu.edu.tw
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Course Outlines Introduction to Structure Biology 2023-09-14(四) |
| 第 2 週 | Pairwise Sequence Alignment (BLAST Dynamic Programming) 2023-09-21(四) |
| 第 3 週 | Scoring matrix: BLOSUM and PAM for sequence alignment 2023-09-28(四) |
| 第 4 週 | Multiple String Alignment and T-COFFEE) 2023-10-05(四) |
| 第 5 週 | Fundamentals of Protein Structures (Protein Data Bank) Molecular Visualization (PdbViewer ) 2023-10-12(四) |
| 第 6 週 | Neural Networks: Secondary structure prediction 2023-10-19(四) |
| 第 7 週 | Protein structure classification & databases 2023-10-26(四) |
| 第 8 週 | Protein structure prediction 2023-11-02(四) |
| 第 9 週 | Introduction to Deep learning AlphaFold: protein structure prediction 2023-11-09(四) |
| 第 10 週 | Introduction to computational drug design 2023-11-16(四) |
| 第 11 週 | Genetic Algorithm: Protein-ligand docking/ drug screening 2023-11-23(四) |
| 第 12 週 | Structure-based drug design and post-screening analysis 2023-11-30(四) |
| 第 13 週 | Decision tree and random forest: Compound similar search and clustering 2023-12-07(四) |
| 第 14 週 | Introduction to systems biology 2023-12-14(四) |
| 第 15 週 | Protein-Protein Interactions and Prediction 2023-12-21(四) |
| 第 16 週 | Final exam 2023-12-28(四) |
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