遺傳資料分析

Genetic Data Analysis

學期

113-2

學分

0 學分

當期課號

130221

永久課號

MDPH30093

開課單位

公共衛生研究所

授課教師

陳建勳、林明薇

校區

陽明

類別

選修

上課時間表

節	週二
7 15:30–16:20	遺傳資料分析 YS107（陽明） 2 節連堂
8 16:30–17:20	遺傳資料分析 YS107（陽明） 2 節連堂

* 根據陽明交大上課時間表所列

概述

介紹遺傳基因研究資料分析方法及軟體,包括:連鎖分析方法,基因關聯分析方法,haplotype 分析方法,全基因體分析方法等。

先修科目

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備註

無備註

教學方式

隨著人類基因體計畫及後續相關計畫的完成,提供我們許多豐富寶貴的基因體研究資料,也帶動許多探索人類疾病相關基因研究計畫的蓬勃展開,本課程將介紹遺傳基因研究的資料分析方法,配合軟體之實際操作及實例分析,讓同學瞭解該如何運用這些分析方法及軟體以尋找人類疾病基因。

評分方式

Class participation 15% 作業及computer practice 作業 15% Case presentation 40% Case presentation written report 30%

課程大綱

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週次計畫

週次	主題
第 1 週	Introduction to genetic data analysis (I) 2025-02-18(二) 時數：[2025-02-18]林明薇(2.00)
第 2 週	Introduction to genetic data analysis (II) 2025-02-25(二) 時數：[2025-02-25]林明薇(2.00)
第 3 週	File system for genetic linkage analysis, Linkage analysis --- LINKAGE, GENEHUNTER 2025-03-04(二) 時數：[2025-03-04]林明薇(2.00)
第 4 週	Linkage analysis --- GENEHUNTER 2025-03-11(二) 時數：[2025-03-11]林明薇(2.00)
第 5 週	Case presentation I 2025-03-18(二) 時數：[2025-03-18]林明薇(2.00)
第 6 週	Association data analysis、Genome-wide association study 2025-03-25(二) 時數：[2025-03-25]林明薇(2.00)
第 7 週	參觀中研院臺灣精準醫學計畫 2025-04-01(二) 時數：[2025-04-01]陳建勳(2.00)
第 8 週	Haplotype analysis --- Haploview (I) 2025-04-08(二) 時數：[2025-04-08]林明薇(2.00)
第 9 週	Haplotype analysis --- Haploview (II) 2025-04-15(二) 時數：[2025-04-15]林明薇(2.00)
第 10 週	Case presentation II 2025-04-22(二) 時數：[2025-04-22]林明薇(2.00)
第 11 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (I) 2025-04-29(二) 時數：[2025-04-29]林明薇(2.00)
第 12 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (II) 2025-05-06(二) 時數：[2025-05-06]林明薇(2.00)
第 13 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (III) 2025-05-13(二) 時數：[2025-05-13]林明薇(2.00)
第 14 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (IV) 2025-05-20(二) 時數：[2025-05-20]林明薇(2.00)
第 15 週	Final Report 2025-05-27(二) 時數：[2025-05-27]林明薇(2.00)
第 16 週	Case presentation III 2025-06-03(二) 時數：[2025-06-03]林明薇(2.00)

教科書

(1) Handbook of Human Genetic Linkage, 1994, Joseph D. Terwilliger &Jurg Ott, Johns Hopkins University Press (2) Genetic Analysis of Complex Disease, 2006, Jonathan L. Haines & Margaret A. Pericak-Vance, Wiley-Liss (藝軒書局) (3) A Statistical Approach to Genetic Epidemiology,2010, Andreas Ziegler and Inke R. Konig, Wiley-Blackwell

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