生物資訊學
Introduction to Bioinformatics
| 節 | 週四 |
|---|---|
3 10:10–11:00 | 生物資訊學 YR102（陽明） 2 節連堂 |
4 11:10–12:00 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
This course will introduce different strategies and computational tools to analyze bio-molecular information, and next-generation DNA/RNA sequencing data, that may facilitate biomedical researches.
Students enrolling in this course should have completed undergraduate courses in (1) Biochemistry and (2) Molecular Biology or Cell Biology. (*** Computer programming skill is not required.) This is not a course of computer language programming (本課程不是電腦語言程式課).
無備註
教師未提供此項資料
課堂出席 turnout (20%), 作業 homework (40%), 期末報告 Term reports (40%)
教師未提供此項資料
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Overview of bioinformatics 2025-09-04(四) 時數：[2025-09-04]黃彥華(2.00) |
| 第 2 週 | Bioinformatics data resources 2025-09-11(四) 時數：[2025-09-11]黃彥華(2.00) |
| 第 3 週 | Sequence alignment and database search 2025-09-18(四) 時數：[2025-09-18]黃彥華(2.00) |
| 第 4 週 | Detecting differentially expressed genes 2025-09-25(四) 時數：[2025-09-25]鍾翊方(2.00) |
| 第 5 週 | Classification and clustering 2025-10-02(四) 時數：[2025-10-02]鍾翊方(2.00) |
| 第 6 週 | Dynamic programming and cloning of genes 2025-10-09(四) 時數：[2025-10-09]黃彥華(2.00) |
| 第 7 週 | Electronic cloning (BioEdit) 2025-10-16(四) 時數：[2025-10-16]黃彥華(2.00) |
| 第 8 週 | Motif and pattern finding in sequencing data (MSA and BioEdit and phylogenetic tree building) 2025-10-23(四) 時數：[2025-10-23]黃彥華(2.00) |
| 第 9 週 | NGS data analysis and disease gene finding 2025-10-30(四) 時數：[2025-10-30]黃彥華(2.00) |
| 第 10 週 | Gene expression profiling (RNA-Seq, scRNA-seq, spatial transcriptomics) 2025-11-06(四) 時數：[2025-11-06]黃彥華(2.00) |
| 第 11 週 | Regulatory motifs 2025-11-13(四) 時數：[2025-11-13]黃彥華(2.00) |
| 第 12 週 | Systems biology, and making sense of the gene expression profiling (RNA-Seq, scRNA-seq, spatial transcriptomics) 2025-11-20(四) 時數：[2025-11-20]黃彥華(2.00) |
| 第 13 週 | Artificial intelligence for biomedical researches (I) 2025-11-27(四) 時數：[2025-11-27]鍾翊方(2.00) |
| 第 14 週 | Artificial intelligence for biomedical researches (II) 2025-12-04(四) 時數：[2025-12-04]黃彥華(2.00) |
| 第 15 週 | Term report (1) 2025-12-11(四) 時數：[2025-12-11]鍾翊方(2.00) 黃彥華(2.00) |
| 第 16 週 | Term report (2) 2025-12-18(四) 時數：[2025-12-18]鍾翊方(2.00) 黃彥華(2.00) |
The materials edited and prepared by the instructor. Journal papers may be assigned by the instructors.
- 地點
- 黃彥華 (守仁樓三樓 309室)
- 時間
- Students are encouraged to contact the instructors to schedule an appointment if they have any questions related to the lecture or homework assignments.
- 聯絡方式
- 黃彥華 yhhuang@nycu.edu.tw