生醫資訊程式設計
Biomedical Informatics Programming
| 節 | 週日 |
|---|---|
Y 06:00–06:50 | 生醫資訊程式設計 2 節連堂 |
Z 07:00–07:50 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
欲進行生醫資料分析,如基因體序列、基因表現量數據,醫學影像辨識,以探索資料與生命現象間的關係,必須具備巨量資料處理之能力。本課程的設計理念,是介紹以自行寫作電腦程式的方式,配合已有之生物資訊軟體,來達到巨量生醫資料分析的目標。本課程期望能達成兩大目的:1) 使學生明瞭電腦程式處理資料之運作原理,2) 使學生有能力撰寫電腦程式,進行資料整合及分析。如此,使學生不再將大資料之處理,視為難以理解的黑盒子。
本課程為程式設計課程,所使用語言為 R 及 Python,於2024年暑期授課,排在以下這幾天 (週二與週四):7/23、7/25、7/30、8/01、8/06、8/08
無備註
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課堂參與 20%, 作業、報告 80%
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Basis for R (I) 2025-09-07(日) 時數：[2025-09-07]鍾翊方(3.00) |
| 第 2 週 | Basis for R (II) 2025-09-14(日) 時數：[2025-09-14]鍾翊方(3.00) |
| 第 3 週 | Plot 2025-09-21(日) 時數：[2025-09-21]鍾翊方(3.00) |
| 第 4 週 | Machine learning application (I) 2025-09-28(日) 時數：[2025-09-28]鍾翊方(3.00) |
| 第 5 週 | Machine learning application (II) 2025-10-05(日) 時數：[2025-10-05]鍾翊方(3.00) |
| 第 6 週 | ggplot2 2025-10-12(日) 時數：[2025-10-12]鍾翊方(3.00) |
| 第 7 週 | A brief introduction to Python and its ecosystem 2025-10-19(日) 時數：[2025-10-19]黃彥華(3.00) |
| 第 8 週 | Types, variables, and loop (1) 2025-10-26(日) 時數：[2025-10-26]黃彥華(3.00) |
| 第 9 週 | Types, variables, and loop (2) 2025-11-02(日) 時數：[2025-11-02]黃彥華(3.00) |
| 第 10 週 | Simple IO and regular expression 2025-11-09(日) 時數：[2025-11-09]黃彥華(3.00) |
| 第 11 週 | Sort and Sympy 2025-11-16(日) 時數：[2025-11-16]黃彥華(3.00) |
| 第 12 週 | Basis for R (II) 2025-11-23(日) 時數：[2025-11-23]黃彥華(3.00) |
| 第 13 週 | 2025-11-30(日) |
| 第 14 週 | 2025-12-07(日) |
| 第 15 週 | 2025-12-14(日) |
| 第 16 週 | 2025-12-21(日) |
教科書: 自編講義 參考書籍及網站: (1) Learning Python, by Mark Lutz (2) Python初學特訓班, by文淵閣工作室 (3) Python超零基礎最快樂學習之路:王者歸來, 深石出版社 (4) Python 資料運算與分析實戰, 旗標出版社 (5) https://docs.python.org/3/tutorial/ (6) https://github.com/topics/learning-python
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