遺傳資料分析

Genetic Data Analysis

學期

114-2

學分

2 學分

當期課號

130218

永久課號

MDPH30093

開課單位

公共衛生研究所

授課教師

陳建勳、林明薇

校區

陽明

類別

選修

上課時間表

節	週二
7 15:30–16:20	遺傳資料分析 YS107（陽明） 2 節連堂
8 16:30–17:20	遺傳資料分析 YS107（陽明） 2 節連堂

* 根據陽明交大上課時間表所列

概述

介紹遺傳基因研究資料分析方法及軟體，包括：連鎖分析方法，基因關聯分析方法，haplotype 分析方法，全基因體分析方法等。

先修科目

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備註

無備註

教學方式

隨著人類基因體計畫及後續相關計畫的完成，提供我們許多豐富寶貴的基因體研究資料，也帶動許多探索人類疾病相關基因研究計畫的蓬勃展開，本課程將介紹遺傳基因研究的資料分析方法，配合軟體之實際操作及實例分析，讓同學瞭解該如何運用這些分析方法及軟體以尋找人類疾病基因。

評分方式

Class participation 15% 作業及computer practice 作業 15% Case presentation 40% Case presentation written report 30%

課程大綱

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週次計畫

週次	主題
第 1 週	Introduction to genetic data analysis (I) 2026-02-24(二) 時數：[2026-02-24]林明薇(2.00)
第 2 週	Introduction to genetic data analysis (II) 2026-03-03(二) 時數：[2026-03-03]林明薇(2.00)
第 3 週	File system for genetic linkage analysis, Linkage analysis --- LINKAGE, GENEHUNTER 2026-03-10(二) 時數：[2026-03-10]林明薇(2.00)
第 4 週	Linkage analysis --- GENEHUNTER 2026-03-17(二) 時數：[2026-03-17]林明薇(2.00)
第 5 週	Case presentation I 2026-03-24(二) 時數：[2026-03-24]林明薇(2.00)
第 6 週	Association data analysis、Genome-wide association study 2026-03-31(二) 時數：[2026-03-31]林明薇(2.00)
第 7 週	參觀中研院臺灣精準醫學計畫 2026-04-07(二) 時數：[2026-04-07]陳建勳(2.00)
第 8 週	Haplotype analysis --- Haploview (I) 2026-04-14(二) 時數：[2026-04-14]林明薇(2.00)
第 9 週	Haplotype analysis --- Haploview (II) 2026-04-21(二) 時數：[2026-04-21]林明薇(2.00)
第 10 週	Case presentation II 2026-04-28(二) 時數：[2026-04-28]林明薇(2.00)
第 11 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (I) 2026-05-05(二) 時數：[2026-05-05]林明薇(2.00)
第 12 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (II) 2026-05-12(二) 時數：[2026-05-12]林明薇(2.00)
第 13 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (III) 2026-05-19(二) 時數：[2026-05-19]林明薇(2.00)
第 14 週	Genome-wide association analysis --- PLINK (IV) 2026-05-26(二) 時數：[2026-05-26]林明薇(2.00)
第 15 週	Case presentation III 2026-06-02(二) 時數：[2026-06-02]林明薇(2.00)
第 16 週	Final Report 2026-06-09(二) 時數：[2026-06-09]林明薇(2.00)

教科書

(1) Handbook of Human Genetic Linkage, 1994, Joseph D. Terwilliger &Jurg Ott, Johns Hopkins University Press (2) Genetic Analysis of Complex Disease, 2006, Jonathan L. Haines & Margaret A. Pericak-Vance, Wiley-Liss (藝軒書局) (3) A Statistical Approach to Genetic Epidemiology,2010, Andreas Ziegler and Inke R. Konig, Wiley-Blackwell

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