基因體數據分析
Genomic Data Analysis
| 節 | 週二 |
|---|---|
3 10:10–11:00 | 基因體數據分析 YR102（陽明） 2 節連堂 |
4 11:10–12:00 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
隨著高通量基因體技術的快速發展，生物醫學研究已累積大量基因表現(Gene Expression)資料，如何從海量且高維度的基因體數據中萃取具生物意義的資訊，已成為精準醫療、生物資訊及人工智慧應用的重要課題。本課程以微陣列(Microarray)基因表現資料分析為主軸，系統性介紹基因體資料分析流程，從資料前處理、差異表現基因偵測、統計假說檢定、資料視覺化，到功能富集分析等核心內容。課程中特別著重於如何從高維度基因體資料中進行特徵選取(Feature Selection)，並進一步運用分群分析(Clustering)與機器學習(Machine Learning)分類模型(Classification)進行疾病診斷、生物標記(Biomarker)發掘及預測模型建構。
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction to Microarray Data Analysis 時數：[2026-09-08]鍾翊方(2.00) |
| 第 2 週 | Microarray Data Preprocessing 時數：[2026-09-15]鍾翊方(2.00) |
| 第 3 週 | Detecting Differentially Expressed Genes (I) 時數：[2026-09-22]鍾翊方(2.00) |
| 第 4 週 | Detecting Differentially Expressed Genes (II) 時數：[2026-09-29]鍾翊方(2.00) |
| 第 5 週 | Hypothesis Testing 時數：[2026-10-06]鍾翊方(2.00) |
| 第 6 週 | Visualization 時數：[2026-10-13]鍾翊方(2.00) |
| 第 7 週 | Clustering (I) 時數：[2026-10-20]鍾翊方(2.00) |
| 第 8 週 | Clustering (II) 時數：[2026-10-27]鍾翊方(2.00) |
| 第 9 週 | Classification (I) 時數：[2026-11-03]鍾翊方(2.00) |
| 第 10 週 | Classification (II) 時數：[2026-11-10]鍾翊方(2.00) |
| 第 11 週 | Classification (III) 時數：[2026-11-17]鍾翊方(2.00) |
| 第 12 週 | Enrichment Analysis 時數：[2026-11-24]鍾翊方(2.00) |
| 第 13 週 | Introduction to Weka & Orange 時數：[2026-12-01]鍾翊方(2.00) |
| 第 14 週 | microRNAs and microRNA Target Genes 時數：[2026-12-08]鍾翊方(2.00) |
| 第 15 週 | Final project presentation 時數：[2026-12-15]鍾翊方(2.00) |
| 第 16 週 | Final project presentation 時數：[2026-12-22]鍾翊方(2.00) |
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