生醫資訊程式設計
Biomedical Informatics Programming
| 節 | 週日 |
|---|---|
Y 06:00–06:50 | 生醫資訊程式設計 2 節連堂 |
Z 07:00–07:50 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
欲進行生醫資料分析，如基因體序列、基因表現量數據，醫學影像辨識，以探索資料與生命現象間的關係，必須具備巨量資料處理之能力。本課程的設計理念，是介紹以自行寫作電腦程式的方式，配合已有之生物資訊軟體，來達到巨量生醫資料分析的目標。本課程期望能達成兩大目的：1) 使學生明瞭電腦程式處理資料之運作原理，2) 使學生有能力撰寫電腦程式，進行資料整合及分析。如此，使學生不再將大資料之處理，視為難以理解的黑盒子。
本課程為程式設計課程，所使用語言為 R 及 Python，於2024年暑期授課，排在以下這幾天 (週二與週四)：7/21、7/23、7/28、7/30、8/4、8/6
無備註
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課堂參與 20%, 作業、報告 80%
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| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Basis for R (I) 2026-09-13(日) 時數：[2026-09-13]鍾翊方(3.00) |
| 第 2 週 | Basis for R (II) 2026-09-20(日) 時數：[2026-09-20]鍾翊方(3.00) |
| 第 3 週 | Plot 2026-09-27(日) 時數：[2026-09-27]鍾翊方(3.00) |
| 第 4 週 | Machine learning application (I) 2026-10-04(日) 時數：[2026-10-04]鍾翊方(3.00) |
| 第 5 週 | Machine learning application (II) 2026-10-11(日) 時數：[2026-10-11]鍾翊方(3.00) |
| 第 6 週 | ggplot2 2026-10-18(日) 時數：[2026-10-18]鍾翊方(3.00) |
| 第 7 週 | A brief introduction to Python and its ecosystem 2026-10-25(日) 時數：[2026-10-25]黃彥華(3.00) |
| 第 8 週 | Types, variables, and loop (1) 2026-11-01(日) 時數：[2026-11-01]黃彥華(3.00) |
| 第 9 週 | Types, variables, and loop (2) 2026-11-08(日) 時數：[2026-11-08]黃彥華(3.00) |
| 第 10 週 | Simple IO and regular expression 2026-11-15(日) 時數：[2026-11-15]黃彥華(3.00) |
| 第 11 週 | Sort and Sympy 2026-11-22(日) 時數：[2026-11-22]黃彥華(3.00) |
| 第 12 週 | Basis for R (II) 2026-11-29(日) 時數：[2026-11-29]黃彥華(3.00) |
| 第 13 週 | 2026-12-06(日) |
| 第 14 週 | 2026-12-13(日) |
| 第 15 週 | 2026-12-20(日) |
| 第 16 週 | 2026-12-27(日) |
教科書: 自編講義 參考書籍及網站： (1) Learning Python, by Mark Lutz (2) Python初學特訓班, by文淵閣工作室 (3) Python超零基礎最快樂學習之路：王者歸來, 深石出版社 (4) Python 資料運算與分析實戰, 旗標出版社 (5) https://docs.python.org/3/tutorial/ (6) https://github.com/topics/learning-python
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