2 項進行中

115-1 選課時程

進行中

  • 初選第一階段 6/15 – 6/18
  • 初選第二階段 6/22 – 6/25
  • 校際選修 進行中 8/24 – 9/18
  • 初選第三階段 8/31 – 9/3
  • 開學後加退選 進行中 9/7 – 9/21
  • 逾期加退選 9/21 – 9/24
選課資源

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分子模擬

Molecular Simulation

學期
115-1
學分
3 學分
當期課號
430109
永久課號
BTBI30007
開課單位
生物資訊及系統生物研究所、生物科技學系、分子醫學與生物工程研究所、工程生物科學學院產業博士班、生醫科學與工程博士學位學程、跨領域神經科學博士學位學程
授課教師
尤禎祥
校區
博愛
類別
選修
上課時間表
週四
5
13:20–14:10
分子模擬
BI304(博愛)
3 節連堂
6
14:20–15:10
7
15:30–16:20

* 根據陽明交大上課時間表所列

概述

Practical application of computational packages will be lectured. Graduate students will learn to perform quantum chemical simulation in the example exercises and to analyze and interpret the computational results.

先修科目

General chemistry, physical chemistry

備註

無備註

教學方式

課程網站 HOMEPAGE: http://wild.life.nctu.edu.tw/class/1151430109/index.html (課堂上公佈密碼) 教科書 TEXTBOOK: (1) http://www.netLibrary.com/urlapi.asp?action=summary&v=1&bookid=105483 (2) http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-77304-7

評分方式

Exercise/Homework 60% Literature/Project report 20% Midterm exam 20%

課程大綱

教師未提供此項資料

週次計畫
週次主題
第 1 週

Basics in computational chemistry Graphical interface, basic UNIX commands and text editors.

2026-09-10(四)
第 2 週

Molecular structure and symmetry

2026-09-17(四)
第 3 週

Group theory and term symbol

2026-09-24(四)
第 4 週

Cartesian coordinate, Z-matrix and their combination Ionization energy and electron affinity

2026-10-01(四)
第 5 週

Energy landscape and structural optimization

2026-10-08(四)
第 6 週

local and global minima, transition states, and minimum energy crossing points

2026-10-15(四)
第 7 週

Potential energy surface and search of transition states

2026-10-22(四)
第 8 週

Vibration frequencies and normal mode analysis

2026-10-29(四)
第 9 週

Molecular orbitals

2026-11-05(四)
第 10 週

Mid-term exam

2026-11-12(四)
第 11 週

Electronic transition

2026-11-19(四)
第 12 週

General basis sets and effective core potential

2026-11-26(四)
第 13 週

Excited-state methods

2026-12-03(四)
第 14 週

Compound methods and thermochemistry

2026-12-10(四)
第 15 週

Multi-layer approaches (ONIOM)

2026-12-17(四)
第 16 週

Quantum mechanical methods combined with molecular mechanics (QM/MM)

2026-12-24(四)
教科書

(1) Computational Chemistry: Introduction to the Theory and Applications of Molecular and Quantum Mechanics, Errol Lewars, Boston Kluwer Academic Publishers, 2003. (2) Computational Chemistry and Molecular Modeling: Principles and Applications, K.I. Ramachandran et. al, Springer-Verlag GmbH, 2008. (3) Electronic Structure Calculations for Solids and Molecules : Theory and Computational Methods, Jorge Kohanoff, Leiden: Cambridge University Press, 2006. (4) Introduction to computational chemistry, F. Jensen, Wiley. (5) Exploring chemistry with electronic structure methods, 2nd Edition, J. B. Foresman and AE. Frisch, Gaussian Inc. (6) Learning the vi Editor, 6th Edition, L. Lamb and A. Robbins, OReilly.

Office Hours
地點
賢齊樓R416
時間
Tuesday 13:30-15:30
聯絡方式
Ext 56962 http://wild.life.nctu.edu.tw/~jsyu